Рустам Кыпшакбаев начал работать в ЮНЭЙДС в 2021 году и он ведёт работу в области прав человека в контексте ВИЧ, включая поддержку правительств по улучшению соблюдения прав человека людей, живущих с ВИЧ, а также укрепление потенциала гражданского общества. Его обязанности также включают укрепление синергии в совместных усилиях правительств, гражданского общества и международного сообщества. 

Рустам является опытным тренером по правам человека, фокусирующимся на философии, истории прав человека, и недискриминации. Он является ментором годичных школ по правам человека в Казахстане и Кыргызстане. Он проводил тренинги для афганских студенток на Зимних школах в Казахстане и Кыргызстане. Он также проводит сессии по правам человека для различных инициатив гражданского общества, включая молодёжь, женщин, уязвимые группы.

До своей работы с ЮНЭЙДС, Рустам работал с УВКПЧ ООН (ООН Права человека), являясь менеджером его проекта по поддержке гражданского общества в сфере свобод выражения, мирных собраний и ассоциации.

До этого, Рустам работал в учреждении Уполномоченного по правам человека Казахстана, где он служил в качестве, последовательно, эксперта, главного эксперта и главы экспертного управления. Его работа включала политические права, недискриминацию и международное сотрудничество.

Рустам обладает магистерской степенью по Правам человека от Лондонской школы экономики и политических наук (Соединенное Королевство, 2017 год), а также степенью по Международному праву от Евразийского национального университета (Казахстан, 2011 год).  

Рустам говорит на казахском, русском, английском и испанском.